🩸 Reconstrucción vascular 3D + interacción microglía-vaso
Retina (corte grueso ~100 µm, montaje en-face) · canal C3 = vasculatura, C2 = Iba-1 · corrida CD68_TEST_ARC_RESULTADOS_20260907_144019
Metodología en una línea: los vasos se segmentaron con umbral de histéresis
(débil/fuerte) calculado por bloques de profundidad de 30 µm —porque la señal cae ~30× entre la
superficie y el fondo—, limitado a los primeros 83 µm (bajo eso solo hay autofluorescencia de
RPE/coroides, no retina neural). Sobre la máscara 3D resultante se calculó la línea central
(esqueleto) y el mapa de distancias euclidianas 3D (respetando que el vóxel mide
0.57×0.57×0.33 µm). Cada microglía de la reconstrucción CD68 se re-segmentó con su umbral
propio y se midió contra ese mapa.
Indicadores globales de la red vascular
Volumen vascular: 90,048 µm³ (1.05% del tejido)
Largo total de la red (esqueleto): 16.0 mm
Radio medio del vaso: 0.94 µm
Cómo leerlos: el volumen vascular es la suma de todos los vóxeles
segmentados como vaso (≈1% del tejido es lo esperado en retina). El esqueleto es la longitud
total de las líneas centrales de todos los vasos — equivale a "cuántos milímetros de cañería" hay
en este campo de 291×291 µm. El radio medio sale de medir, en cada punto de la línea central,
la distancia a la pared del vaso: valores ~1 µm indican predominio de capilares; los troncos
grandes del campo llegan a 3–6 µm.
| Capa | % del volumen de la capa que es vaso | Esqueleto en la capa |
|---|
| GCL/IPL | 2.01% | 5,351 µm |
| INL | 0.0% | 6 µm |
| OPL | 0.01% | 7 µm |
| ONL | 1.06% | 9,258 µm |
| PS | 0.44% | 1,379 µm |
Vascularización por capa: la retina interna (GCL/IPL) concentra el plexo
superficial (2%), mientras INL/OPL aparecen casi avasculares en este marcaje. La señal
atribuida a ONL corresponde mayormente a parches del lecho coriocapilar que se cuelan por la
inclinación del tejido — ver advertencias al final.
Tabla por célula — qué significa cada columna
| Célula | Capa | Z µm | Fenotipo | Soma→vaso µm | Tip mín µm | Tip medio µm | % célula <5 µm | CD68 |
|---|
| ID003 | GCL/IPL | 8.2 | Homeostatic | 2.29 | 0.0 | 2.71 | 91.6% | 2730.0 |
| ID004 | ONL | 47.1 | Homeostatic | 39.57 | 16.32 | 36.7 | 0.0% | 711.3 |
| ID006 | ONL | 47.7 | Homeostatic | 29.05 | 7.4 | 31.86 | 0.0% | 612.6 |
| ID007 | GCL/IPL | 7.9 | Ameboid | 0.0 | 0.0 | 4.23 | 78.6% | 955.9 |
| ID008 | ONL | 50.2 | Homeostatic | 22.55 | 5.61 | 27.25 | 0.7% | 759.3 |
| ID013 | GCL/IPL | 9.1 | Hypertrophic | 1.14 | 0.0 | 9.72 | 60.7% | 1609.3 |
| ID014 | GCL/IPL | 6.4 | Ameboid | 0.87 | 0.0 | 3.75 | 88.2% | 1921.0 |
| ID018 | GCL/IPL | 9.1 | Hypertrophic | 1.31 | 0.0 | 6.19 | 61.2% | 17105.9 |
| ID022 | GCL/IPL | 5.9 | Homeostatic | 0.66 | 0.0 | 2.08 | 96.7% | 1760.7 |
Capa / Z µm: posición del soma en profundidad, asignada a capa retiniana según el perfil de
densidad DAPI (GCL/IPL <30 µm · INL 30–43 · OPL 43–47 · ONL 47–83).
Soma→vaso: distancia 3D desde el centro del soma hasta la superficie del vaso más
cercano. 0–2 µm = célula perivascular (pegada a la pared).
Tip mín / Tip medio: las "tips" son las puntas de los procesos (extremos del esqueleto
de la propia microglía). Tip mín = la punta más cercana a un vaso — si es 0, la célula está
tocando el vaso con al menos un proceso; tip medio promedia todas las puntas e indica hacia
dónde está desplegado el árbol.
% célula <5 µm: fracción del volumen celular completo que queda a menos de 5 µm de un vaso
("cobertura de contacto"). >60% = célula envolviendo al vaso; 0% = célula sin relación vascular.
CD68: intensidad media del marcador lisosomal/fagocítico dentro del volumen reconstruido
(de la corrida CD68) — permite correlacionar activación con posición vascular.
Lectura biológica de esta muestra: las 6 células de GCL/IPL son
perivasculares estrictas (soma ≤2.3 µm, todas tocando el vaso con sus procesos, 61–97% de contacto)
y concentran el CD68 alto — perfil de macrófago/microglía activada asociada al plexo superficial.
Las 3 células profundas viven a 22–40 µm del vaso más cercano pero igual orientan procesos
hacia él (tips a 5.6–16 µm), con CD68 bajo — perfil homeostático de vigilancia.
🧊 Reconstrucción 3D — vasos + microglías
Qué ves: el volumen vascular reconstruido (rojo translúcido) con las 9 microglías
reconstruidas en su posición real, giro completo de 360° (~15 s). Colores por morfotipo:
verde = Homeostatic (ramificada, vigilancia),
naranja = Hypertrophic (activación intermedia),
amarillo = Ameboid (activación máxima/fagocítica).
Nota cómo las Hypertrophic/Ameboid (CD68 alto) están adosadas a los troncos vasculares del plexo
superficial, mientras varias Homeostatic verdes flotan lejos del vaso en la retina profunda.
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Chrome: Configuración → Sistema → Usar aceleración de gráficos y reiniciar. El GIF de
arriba muestra lo mismo sin requisitos.
🗺️ Mapa XY — red vascular y posición de las células
Qué ves: proyección de máxima intensidad (vista "desde arriba") del canal
vascular (rojo) con la línea central del esqueleto en amarillo — cada línea amarilla recorre
el eje de un vaso; las mallas amarillas finas son lechos capilares/coriocapilar. Los círculos
son los somas de las microglías, coloreados por capa, con su ID y la distancia soma→vaso anotada
(ej. "018 (1µm)"). Sirve para ver de un vistazo qué células cuelgan de qué tronco.
📐 Vista lateral X–Z — profundidad y plexos
Qué ves: el mismo stack pero mirado "de canto": el eje vertical es la
profundidad Z en planos (multiplica por 0.33 para µm; 0 = superficie vítrea). La banda brillante
inferior es el plexo vascular superficial (0–20 µm), donde viven las células cian. Las
líneas blancas marcan los límites de capa estimados con DAPI (GCL, INL, OPL, ONL). Nota que la
banda no es plana: el tejido está levemente inclinado/ondulado — por eso la asignación de capas
por Z absoluto es aproximada.
📊 Distancias por célula
Qué ves: para cada célula, la barra roja
es la distancia soma→vaso y la naranja la punta de proceso
más cercana al vaso. La línea negra parte en el promedio de todas las puntas y sube hasta la
punta más lejana — un rango largo indica un árbol muy extendido. La línea punteada gris a
5 µm es el umbral convencional de "contacto vascular": barras bajo esa línea = célula en
contacto físico con el vaso. Patrón de la muestra: todas las GCL/IPL bajo el umbral; las tres ONL
claramente sobre él, con sus puntas "estirándose" hacia el vaso.
⚠️ Advertencias metodológicas
1. Solo plexo superficial: el marcaje vascular de esta imagen solo cubre el plexo superficial
(0–20 µm); a ~48 µm (plexo profundo esperado) no hay señal de vasos. Las distancias de las células
profundas están medidas contra el plexo superficial y contra parches de coriocapilar.
2. Tejido inclinado: las capas por Z absoluto son aproximadas (±5–10 µm según la zona del campo).
3. Resolución: imagen exportada a 512×512 (0.57 µm/px, mitad de la resolución de adquisición) —
los capilares más finos y los procesos distales más delgados están subrepresentados. Con el export
a 1024×1024 nativo estos números ganarían fidelidad.
4. Archivos de datos: vessel_microglia_metrics.csv (tabla por célula) y
vessel_summary.json (todos los indicadores).